小孩不自主的摇头可能存在神经发育异常或者是脑部疾病等问题所造成的，比如说癫痫、大脑发育异常等。若感觉孩子症状比较敏感，比较严重的话，最好是带孩子到医院通过脑部ct或者是核磁共振等方式来明确检查，发现异常也好及时进行治疗，避免延误最佳治疗时间。