巧克力囊肿六公分也是需要手术治疗的。可以微创腹腔镜卵巢巧克力囊肿剥除术。术后注射亮丙瑞林，抑制复发。否则继续长大会导致巧克力囊肿破裂。引起盆腔子宫内膜种植。引起盆腔子宫内膜异位症。就更不好治疗了。