半夜突然头疼疼醒可能是颅内病变，也可能是神经血管性头痛引起的，这种症状多发于40以内的青壮年人，这种疾病一般多发于夜间，在病情发作时可以在医生指导下服用药物治疗，平时也可以通过服用麦角胺类药物来预防疾病。如果症状比较严重，可以到医院通过吸氧的方法来做辅助治疗。