三期梅毒的治疗方法有下面两种：1.西医治疗方法，梅毒的青霉素治疗方案：①晚期梅毒包括有三期皮肤、黏膜、骨损害的患者和病期在两年以上的潜伏梅毒以及心血管梅毒和神经梅毒等。对于良性晚期梅毒（血管、黏膜及骨等）的治疗可予普鲁卡因青霉素G肌肉注射，或用苄星青霉素肌肉注射。②对于心血管和中枢神经系统梅毒不用苄星青霉素而用普鲁卡因青霉素肌肉注射。③两岁以上的先天梅毒治疗方法可按成人的相应病期进行，其用量不超过成人的剂量。2.中医治疗方法。治疗则以驱邪为主，兼顾扶正，使邪毒去，元气充，而奏效。本病的治疗，应以抗生素治疗为主，中药治疗为辅，在抗生素中，以青霉素为主，宜足量，连续用药，务必彻底。而中医药除一般辅助治疗外，尚可以提高机体免疫力，实现治疗效果。