打完脑膜炎疫苗发烧39度，在医生的指导下给孩子口服退烧的药物来进行退烧，可能是疫苗的不良反应所引起的发烧，注射完疫苗之后身体都会出现一些异常，有的人还会出现恶心呕吐胸闷等症状，一定让孩子多喝水，补充身体的水分，别让孩子来回走动，多注意休息。