磁共振是影像学检查，主要用于检查机体组织器官的异常形态变化，从而作出明确的诊断。而脑炎是一种感染性炎性病变，磁共振对颅内脑组织的检查也具有明显的优势，所以磁共振能够检查出来脑膜炎。特别是对诊断早期感染性脑膜炎，还是具有重要的临床应用价值。但是对于脑炎的诊断，磁共振不是检查脑炎的首选方法。