大部分是不能自愈的，需要在医生指导下长时间使用药物，可以采取抑制胃酸分泌，保护胃黏膜药物来进行治疗，能帮助消化和吸收。使用药物的同时要改善饮食结构，饮食上要多清淡少油腻，饮食上要有规律，千万不要抽烟饮酒，不要吃刺激性的食物。以免对肠胃带来负担，很可能还会加重功能性消化不良。