小腹部隐隐作痛的原因有可能是盆腔炎症性疾病引起的，也可能是子宫肌瘤、卵巢囊肿等妇科疾病所致。也有可能是因为慢性肠炎或者肠道肿瘤性疾病或者慢性膀胱炎等引起的。需要根据伴随的临床症状、必要的辅助检查才能确诊。患者可以到医院做超声检查和血尿常规化验检查，明确诊断。