核磁共振是可以检查肠道的，但是核磁共振，只能检查肠道部位是否出现肿瘤或者是较大的息肉，如果是肠道溃疡和慢性肠炎等消化系统疾病，通过核磁共振是检查不出来的。对消化系统疾病要通过结肠镜检查或者是结肠部位造影等方式进行检查，在做检查前需要空腹，不可以吃饭和喝水。