幽门螺旋杆菌碳13和碳14之间的区别在于，碳13没有辐射性，但碳14具有一定的辐射性。目前临床上应用较多的为碳13，具有较高的灵敏度，适用于哺乳期的女性儿童以及孕妇。两者之间在价格上也有区别，通常碳13的检测价格要高于碳14的检测价格，但两者都是用来检测患者是否存在幽门螺旋杆菌感染的检查项目。