做肠镜检查一般是不痛苦的，可以选择无痛的肠镜进行检查。而宝宝存在有肚子疼的情况，一般做肠镜前需要给予导泻的药物进行治疗，让肠道清洁，然后术前准备就绪后将镜子通过肛门插入后，然后在显示器上进行显示肠道内是否存在有炎症、肿物、息肉、包块的情况发生，对于明确诊断的作用是比较好的。