巨结肠在治疗上可以采用保守疗法和手术疗法来进行治疗。对于病情比较轻微的患者，或者是暂时无法接受手术进行治疗的患者，可以先采用保守疗法来做治疗，保守疗法主要是扩肛、开塞露塞肛等。如果病情是比较严重需要进行手术治疗的，需要先进行结肠造口，结肠造口之后再实施根治手术。