肠道菌群检测价格需要100元左右，具体的价格和医院大小有一定的关系，会有些差别。如果不确定病因的话，可以去做肠道菌群检测，可以起到排除肠道病变的情况，可以根据结果来进行对应治疗。一般如果有肠道菌群失衡情况，会出现腹痛、腹泻，要及时进行处理，避免出现营养不良，影响身体健康。