吗替麦考酚酯副作用是会引起消化道出现异常反应，有些患者会表现出恶心、呕吐以及腹泻的一些症状。长期服用很有可能会使身体白细胞减少，导致患者出现脓毒症，身体还会对药物产生依赖性。在服用药物一段时间以后，可以去医院检查肾功能，如果身体各项指标都正常，在医生指导下减少药物用量。