主要是含有的菌群数量不同。二联活菌含有的菌群数量偏少，主要是酪酸菌状芽孢杆菌并且易于婴儿不用的双歧杆菌，四联活菌类主要是粪肠球菌同时还添加了那样芽孢球菌，比二联活菌多两种菌群。但是在服用效果上，并没有太大的区别。二联活菌适合婴幼儿服用，可较好的改善腹泻和消化不良等胃肠道不适症状。