需要配合医生使用消炎抗感染和调理肠道菌群的药物来进行治疗。细菌性肠炎有可能是肠道出现细菌感染或者炎症感染引起的，需要到医院做一个大便常规检查明确病情以后再进行治疗。在治疗的时候还要观察一下宝宝的精神状态，严重的情况下需要通过静脉注射的方法来进行治疗。