这两种药物都能起到消毒以及抗菌，但是碘酒有刺激性，在涂抹的时候可能会引起疼痛感，而碘伏并没有刺激，有利于让粘膜组织和伤口内部更好的消毒，但是碘酒通常只用做皮肤消毒，不能消毒粘膜，因为碘酒对粘膜会灼伤。碘酒对细菌和真菌有很强的杀灭，有利于治疗毛囊炎和皮脂腺炎等疾病。