甲亢生孩子畸形率不是特别高。患有甲亢的女性，如果甲状腺功能没有减退，经过及时的调整甲状腺激素水平恢复正常，不会影响到胎儿的生长发育，不要私自服用药物治疗，否则会影响胎儿。如果患有甲亢后没有及时治疗，引起甲状腺激素水平过高的现象，这种情况可能会导致胎儿畸形，要到医院进行系统治疗。