通常会引起疼痛。甲状腺活检穿刺通常用于确诊甲状腺组织是否有其他异常情况，虽然在局部用过麻药后，但是不能够完全达到止痛的效果，因此在做甲状腺穿刺的时候，可能会有局部疼痛的现象。如果再做完甲状腺活检穿刺后疼痛比较严重，可以在医生的指导下使用止痛类的药物进行治疗。