区别是病情严重程度不同，而且性质也是不一样的。甲状腺结节多数是长期不规律的饮食习惯所引起，或者局部逐渐轻微疼痛感，而且还会伴随着吞咽困难，在通过口服药物之后，一般是可以使病症得到控制。而甲状腺囊肿病情比较严重，大多需要通过手术切除的方法来进行治疗，才能够将囊肿彻底切除，还需要送往化验室进行化验。