甲状腺穿刺目前没有太多的副作用。在穿刺后，可能会引起细菌感染和伤口出血，而感染和出血会引起局部肿胀、疼痛和其他不适症状。在严重的情况下，可能会损坏甲状腺周围的神经以及血管。不过，这些副作用很少见，所以患者不必担心，只需按照医生的指示进行穿刺即可。