膀胱灌注后的副作用可能出现发烧、肌肉酸痛，身上出虚汗，甚至还有的患者可能会出现轻度的结核菌感。膀胱灌注后还有一些不良反应，比如说像膀胱受到刺激，出现尿多尿急等症状，在膀胱灌注过程中，如果出现操作不当，还有可能会出现尿路感染等症状。所以在做膀胱灌注时，一定要去正规的医院进行治疗。