肛门疼痛是否可以吃阿莫西林，主要是由于病因来决定的。如果是由于炎症导致的肛门疼痛，这种情况可以在医生的指导下服用阿莫西林，并且要按时按量来服用，因为阿莫西林具有杀菌的效果，可以很好的缓解疼痛。肛门疼痛还有可能是由于痔疮或者脓肿造成的，这种情况就就需要进行手术治疗。