要根据肛门溃疡的原因选择药物。由于肛周脓肿导致的溃烂，可以使用抗生素类外部涂抹药膏对出现溃烂部位进行涂抹。如果是由于湿疹引起的局部溃烂，要首先使用止痒药物进行止痒，在使用治疗皮肤问题的药膏对患处进行涂抹。如果是因为痔疮破裂导致的肛门溃疡，要使用痔类药物对患处进行涂抹。