肛瘘手术由于属于肛门处手术，且因为存在瘘道，所以手术需要切开瘘道，切除瘘道组织，术后创面也多较大，恢复时间较慢。在恢复期间，为了避免创面裂伤，进而引起出血或者影响愈合，建议在创面完全愈合后再进行性生活。肛瘘手术创面完全愈合多需要30—40天的时间，部分患者会更长。