通常可遵医嘱服用止痛类的药物进行治疗，还可以使用抗生素的药物缓解瘙痒的症状，另外也可以使用药物坐浴的方式缓解肛门疼痛的症状。但如果肛窦炎的情况比较严重，应及时到医院采取手术的方式进行治疗，以免对身体造成严重的影响。在治疗期间也应保持大便的通畅，避免吃一些刺激性的食物。