肛瘘手术后是否会出现复发，主要还是以肛瘘的严重程度以及手术操作的技术水平等有关系。比如单纯的低位肛瘘或者高外肛瘘，彻底的清除瘘道者，完全愈合后，基本是是不会复发的，但是如果瘘道不彻底则容易复发。另外对于复杂性的肛瘘，手术难度相对较大，术后容易复发。