肛门间歇性疼痛主要是痔疮所引起的疼痛，也不排除是肛瘘或者是肛周脓肿的情况，可以去医院的肛肠干做一个相关的检查，如果是痔疮可以通过痔疮药膏来进行涂抹。如果长时间大便干燥也会导致肛裂的情况，肛裂在排便的时候都会出现阵发性的疼痛，平时一定要多吃一些膳食纤维的食品，避免长时间便秘。