肛窦炎是由于肛窦处被粪便刺激或者不当的饮食等，导致的细菌感染。所以在治疗上需要服用相关的消炎药抗感染治疗，比如比较常用的β内酰胺类药物、大环内脂类药物等。除了口服消炎药外，还可以采取局部治疗，可以肛门处采用消炎药栓剂或者相关痔疮膏等，平时要注意合理饮食，便后进行温水坐浴，有利于恢复。