婴儿患有肛瘘，手术的时间并没有明确的规定，大多是达到了手术的标准后，就可以进行手术治疗。手术可以从根本上解决肛瘘的问题，而采用药物保守救治的方式，只能起到压制和缓解的作用，并不能彻底的治疗肛瘘的问题。由于婴儿较小，因此术后要护理的更为仔细，以免发生其他的并发症。