检查前需要禁食，准备口服泻药清洁肠道才可进行结肠镜检查。检查时首先侧卧在桌子上，放松准备检查。医生从肛门插入一根带有摄像头的细管，插入后将其推入深处。检查时有可能在推进过程中使肠道充气，以便进行结肠镜检查。当结肠镜到达检查部位时医生和病人都可以从电脑显示器上观察肠道的内部情况，如有必要医生还将使用结肠镜检查肠道样本以备下次活检。