通常并不会引起副作用和后遗症。无痛肠镜检查通常是注射麻醉后睡眠过程中检查，够明确患者身体是否存在有炎症感染或是肠道息肉以及肠道病变疾病。检查后可能会使患者腹部有轻微胀气和不适症状，随着身体逐渐恢复，能够回归正常并不会诱发不良反应，避免过分担心和焦虑，不会使健康受到影响。