做了胆肠吻合手术的患者，后期出现的并发症主要就包括肠梗阻，胆漏，胆汁反流性胃炎等疾病。做完胆肠吻合术以后，奥迪氏括约肌的功能失常，不能起到正常的抗反流作用，进入到肠道内的胆汁就会逆行进入胃内，引起胆汁反流性胃炎；如果吻合口发生狭窄，就会引起梗阻现象。如果吻合口部位发生炎症反应或者缝合不好，则会形成漏。