新生儿42天检查，应该挂儿童保健科。正常情况下，新生儿在出生后一周和一个月都要进行常规体检，了解孩子的生长发育情况。如果宝宝发生异常，就应该及时到医院进行检查治疗，一般情况下可以挂儿童保健科就诊，如果通过儿童保健科的检查，发现宝宝属于其他科室的疾病，还可以转到相应的科室就诊。