口腔体温计和腋下体温计的主要区别是测量的方式不同，而且标准也有所差异。口腔体温计主要是测量口腔内的温度，腋下体温计主要是用来测量腋下的温度，正常情况下口腔的体温温度应该在38.5~36点9度之间，腋下的正常温度应该在36~37.3度之间。口腔体温计的探头比腋下体温计的探头长。