参术儿康糖浆的副作用大多是出现在消化系统的症状，比如说可以出现恶心，呕吐，腹痛，腹泻以及出现消化不良，也可能出现脾虚胃寒，睡眠质量下降，精子成活率减低以及内分泌功能的陨落，同时还会导致免疫功能的下降。对于儿童服用这种药物以后，会出现皮肤的瘙痒以及外阴瘙痒，特别是对于女性患者来说。