脚底囊肿是可能会自行消失的。不过是要根据囊肿的严重程度，一般来说，如果脚底囊肿较小的话，及时去医院进行注射疗法，如果囊肿逐渐增大，发展为恶性囊肿，就需要进行麻痹手术，将囊肿切除。日常生活中可以用盐水泡脚，避免脚部被病毒感染，要多卧床休息，不要过度劳累，避免脚部囊肿病情恶化。