大脚骨骨头里隐隐的疼可能是所穿的鞋子不合脚引起的，也有可能是扁平足、类风湿等疾病引起。如果疼痛比较轻微，可在医生的指导下通过保守的方法进行治疗，同时要给于热敷、理疗等方法辅助治疗，要穿宽松舒适的鞋子，如果保守治疗效果不明显或者症状比较严重时，可在医生的指导下通过手术的方法进行矫正。