药物流产没有干净的情况下，做清宫手术治疗清宫过程中是会有疼痛感的。但是，疼痛程度的严重程度，在不同的个体之间有一定的差异。绝大多数的患者在清宫手术的过程中都表现为胀痛或者是隐痛不适感，可以耐受。如果对疼痛敏感性较强，而或者是非常惧怕疼痛，那么可以考虑在麻醉下进行清宫手术。