巧克力囊肿可能影响月经周期，有可能导致月经推迟或者是引起月经不调，但是它主要表现为经期腹痛，而且出现进行性加重，严重的引起不孕不育。巧克力囊肿是由于异位的子宫内膜，在卵巢生长随着月经周期的出血形成陈旧性积血的囊肿称为巧克力囊肿，如果一旦确诊是需要治疗的。