一般不会对输卵管产生影响。如果自身患有巧克力囊肿，不仅会出现痛经的情况，也有可能会性交疼痛如果治疗不及时，可能会引起女性不孕。通常需要通过做手术的方法进行治疗，但是做手术的时候最好选择正规大型的医疗机构，由技术成熟的医生操作能够大大的降低术后并发症的发生。