女性服用流产药物孕囊排出以后，有肚子疼的现象，很可能是宫内还有残留的组织物没有排出，因为药流后不只会有孕囊排出，一些胚胎的相关组织物也是需要排出的。如果没有排出来，就会对宫腔造成不断的刺激，从而引起疼痛，这种情况就需要做进一步的检查，确定残留物的大小后，在选择对应的清宫方式进行治疗。另外，也有可能是患者有妇科炎症，药物流产时造成了刺激，引起疼痛。