一般没有影响。但去办健康证时尽量在早晨空腹去，由于办健康证通常需要检查肝功能以及抽血化验，需要化验转氨酶是否有升高的变化，而且同时还需要进行胸部的X光检查，排除有无肺结核疾病。有的还需要大便常规的化验，排除体内有无痢疾杆菌和霍乱弧菌，以上检查如果都符合相关规定后，可发放健康证，所以办健康证与来大姨妈没有关系。