卵巢囊肿手术在月经干净后1周内做比较合适。如果检查确诊囊肿比较大，并且引起了腹部的疼痛、月经失调等并发症，最好是到正规的医院安排手术。手术治疗的效果比较好，并且在手术之后病情反复的可能性特别低。但是注意按时到医院做术后的复查，不宜在短时间内安排性生活，警惕伤口的感染。