当女性检查乳腺囊肿5厘米是需要手术的。这时候囊肿较大，一般在手术后也要及时的将切除的组织送病理化验，有利于明确囊肿的性质。因此在平时的时候若出现乳房胀痛，也要定期做乳腺B超进行检查，有利于明确身体的健康状况，尽早处理才有利于身体的健康恢复。