乳腺囊肿三级最好的治疗方法，一般是囊肿较小，可以先给予活血化瘀，抗炎的药物进行治疗；如果是囊肿较大直径达一厘米以上，需要给予手术切除，术中送病理化验，以明确囊肿的性质，是良性的病变，以后定期复查就可以；若是存在有恶性的病变也要给予放化疗等进行综合性的处理方式了。