胆囊腺肌症最好是采取手术的方式进行治疗，可以将胆囊切除，因为胆囊腺肌症虽然大多是良性的，不过还是有导致癌变的可能性，所以将胆囊切除是较好的一种治疗方式。如果患者是胆囊的局部有增厚的现象，可以将局部增厚的部位切除，也可以考虑做保胆手术，如果情况严重，最好是将整个胆囊切除。