沙眼衣原体阳性的话，主要是因为患者感染了衣原体导致的，有可能会出现结膜炎、眼炎等疾病。而在治疗上患者需要局部使用一些抗生素进行治疗，在治疗期间要注意眼部的清洁卫生，不能够用手去触摸眼睛，避免导致病情加重。另外还要注意用眼的习惯，不要长时间用眼，要适当地闭眼休息。