注射完HPV疫苗以后，月经不正常了应该不是疫苗导致的副作用。HPV疫苗的副作用一般会导致局部红肿疼痛症状，或者有低热现象，一般无需处理。慢慢就会自行消退的。月经提前或错后不超过七天就属于正常，如果超过七天以上就需要在月经来的第二天到第五天内，去医院抽血化验一下激素六项，看是否是由于内分泌失调而引起的月经不调。