怀孕41天可以做B超检查，如果月经比较规律，正常情况下大多在怀孕5周就可以通过做B超检查，判断宫腔内有没有孕囊。所以在这个期间做B超检查，主要是可以排除宫外孕的现象，同时也可以根据孕囊大小来判断是否符合怀孕天数，等到怀孕50天以后，做B超复查，判断有没有胎心以及胎芽的发育。